La investigación asociada a la Maestría en Historia Aplicada se caracteriza por su diversidad temática. Este es el resultado de la existencia de un cuerpo de investigadores con formaciones académicas e intereses diferenciados. Los docentes del postgrado han realizado sus estudios de doctorado o maestría en Estados Unidos, Europa, América Latina y Costa Rica, en comunidades científicas y líneas teóricas distintas. Entorno a la Maestría existe una tradición arraigada de Historia Agraria y Económica, así como de estudios de movimientos sociales, fuerzas políticas y cambio cultural los cuales, durante los últimos años, se han enriquecido con la incorporación de nuevas dimensiones de análisis como la Historia Ambiental, estudios culturales y étnicos, preocupaciones acerca de subjetividades e identidades, historia de la Iglesia y de la justicia, así como Didáctica de la Historia. Existe un interés por desarrollar estudios que permitan el encuentro de dos o más temáticas o áreas disciplinarias entorno a un problema de investigación. Asimismo, es cada vez más importante la inclusión de la perspectiva histórica global en las diferentes investigaciones.
